Los poríferos se pueden reproducir tanto asexual como sexualmente. Para el primer caso existen tres métodos diferentes. El primero es la fragmentación, cuando un fragmento de la esponja se separa del resto del cuerpo, éste puede reconstruir las partes que faltan y convertirse en una esponja funcional. Las otras maneras de reproducirse son produciendo pequeñas yemas que se desprenden o generando gémulas bastante más complejas. Estos dos métodos están limitados a algunas especies
.

En cuanto a la reproducción sexual de los poríferos, la mayoría de esponjas son hermafroditas. No disponen de gónadas y los espermatozoides normalmente están formados por los coanocitos y los óvulos por la transformación de archeocitos. Generalmente la fecundación se realiza entre distintos organismos: se expulsan los espermatozoides al agua y entran por los poros de otra esponja donde se transforman y se llevan hasta el mesohilo para encontrarse con los óvulos. La mayoría de especies retiene los huevos fertilizados hasta que nace el nuevo organismo, que lo hace en forma de larva móvil con cilios o flagelos.
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